Визија Института за јавно здравље Ниш је да у Републици Србији буде један од лидера у креирању и споровођењу јавно-здравствених политика и стожер око кога ће се окупљати сви актери у области јавног здравља на новоу локалних заједница Нишавског, Топличког округа али и читавог региона Југоисточне Србије. Институт за јавно здравље Ниш истовремено настоји да буде пример добре праксе на пољу умрежавања са националним и интернационалним креаторима и носиоцима јавно здравствених иницијатива.